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| Establishment of SNPs markers of the laboratory red crucian carp C1HD strain |
| ZHU Feng1 WU Duansheng2 |
1.Endocrinology Division, the Affiliated Hospital of Jinggangshan University, Jiangxi Province, Ji′an 343009, China;
2.Department of Laboratory Animal Science，University of South China, Hu′nan Province, Hengyang 421001, China |
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Abstract Objective To establish SNP markers of the laboratory red crucian carp C1HD strain. Methods SNPs primers were designed referring to SNPs gene library of the Zebrafish, the SNPs were genotyped by single-tube bi-directional allele-specific amplification (SB-ASA) and were verified by sequencing for the laboratory red crucian carp C1HD strain. Results SNPs-PCR of blood DNA samples of laboratory red crucian carp could be genotyping of three sites Zk261O7 gene zSNP30124211 (G/A type), zC227H20 gene zSNP24678043 (A/T type) and zC39F23 gene zSNP26474328(G/C type). These three SNP markers were able to accurately identify the laboratory red crucian carp C1HD strain and the laboratory red crucian carp closed colony. Conclusion Three SNPs markers of Zk261O7 gene loci zSNP30124211 (G/A type), zC227H20 gene loci zSNP24678043 (A/T type) and zC39F23 gene loci zSNP26474328(G/C type) could be used as SNPs markers in the laboratory red crucian carp.
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