基于网络药理学探讨肾元颗粒治疗糖尿病肾病的作用机制

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摘要目的基于网络药理学探讨肾元颗粒治疗糖尿病肾病的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台收集肾元颗粒药物成分及作用靶点；通过GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD和DrugBank数据库收集糖尿病肾病靶标基因，将药物和疾病靶点取交集得到该方治疗糖尿病肾病交集靶点；采用Cytoscape 3.7.2软件构建肾元颗粒成分-交集靶点-疾病网络；采用STRING数据库分析交集靶点构建蛋白互作网络；采用CytoNCA拓扑属性构建关键靶点蛋白拓扑图，根据节点度值和中介中心度值对交集基因靶点及化合物成分进行排序；借助R语言对关键靶点行GO生物学过程和KEGG代谢通路分析。结果筛选得到肾元颗粒化合物成分35种，预测作用靶点292个，药物与糖尿病肾病交集靶点数67个；将交集蛋白上传至STRING数据库，获得55个交集蛋白；关键靶点拓扑图显示前3个化合物成分是槲皮素、7-O-甲基异丁香酚、山柰酚；关键靶点是蛋白激酶B、血管内皮生长因子A、表皮生长因子受体；GO富集分析显示主要涉及G蛋白偶联受体等生物过程，突触前膜、后膜等细胞成分；G蛋白偶联胺受体活性等分子功能；KEGG代谢通路富集分析结果显示主要涉及刺激神经组织作用通路等。结论初步验证了肾元颗粒组方合理性及其治疗糖尿病肾病科学性，并为深入探讨肾元颗粒治疗糖尿病肾病机制奠定理论基础。

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关键词 ：肾元颗粒, 糖尿病肾病, 网络药理学, 作用机制

Abstract：Objective To explore the mechanism of action of Shenyuan Granules in treating diabetic nephropathy based on network pharmacology. Methods Through the traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, the pharmaceutical components and action targets of Shenyuan Granules were collected. Target genes of diabetic nephropathy were collected from GeneCards, OMIM, PharmGKB, TTD, and DrugBank databases, and the intersection of drug and disease targets was taken to obtain the intersection target of the prescription for treating diabetic nephropathy. Cytoscape 3.7.2 software was used to construct the Shenyuan Granules composition-intersection target-disease network. The STRING database was used to analyze the intersection targets and construct the protein interaction network. The CytoNCA topological properties were used to construct the topological map of key target proteins, and the intersection gene targets and compounds were ranked according to the nodal degree and intermediate centrality. GO biological processes and KEGG metabolic pathways of key targets were analyzed by R language. Results Thirty-five compounds were selected and 292 predicted targets of Shenyuan Granules were obtained. The number of intersection targets between drugs and diabetic nephropathy was 67. The intersection proteins were uploaded to the STRING database and 55 intersection proteins were obtained. The topology of key targets showed that the first three compounds were quercetin, 7-O-methylisopeugenol and kaempferol. Key targets were protein kinase B, vascular endothelial growth factor A and epidermal growth factor receptor. GO enrichment analysis showed that it mainly involved biological processes such as G-protein-coupled receptors, cellular components such as presynaptic membrane and postsynaptic membrane, and molecular functions such as G protein-coupled amine receptor activity. The enrichment analysis of KEGG metabolism pathway showed that it was mainly involved in stimulating neural tissue action pathway and so on. Conclusion The rationality of the prescription of Shenyuan Granules and the scientificity of the treatment of diabetic nephropathy are preliminarily verified, and the theoretical foundation is laid for the in-depth study of the mechanism of treating diabetic nephropathy with Shenyuan Granules.

Key words： Shenyuan Granules Diabetic nephropathy Network pharmacology Mechanism of action

基金资助:国家自然科学基金资助项目（81874439）。

通讯作者: 王小琴（1963.9-），女，博士，博士生导师，主任医师，教授；研究方向：中医药防治肾病。

作者简介: 万亚琴（1984.10-），女，湖北中医药大学中医临床医学院2015级中医肾病专业在读博士研究生；研究方向：中医药防治肾病。

引用本文:

万亚琴1 王小琴2. 基于网络药理学探讨肾元颗粒治疗糖尿病肾病的作用机制[J]. 中国医药导报, 2021, 18(25): 14-18.
WAN Yaqin1 WANG Xiaoqin2. Discussion on the mechanism of action of Shenyuan Granules in treating diabetic nephropathy based on network pharmacology. 中国医药导报, 2021, 18(25): 14-18.

链接本文:

https://www.yiyaodaobao.com.cn/CN/ 或 https://www.yiyaodaobao.com.cn/CN/Y2021/V18/I25/14

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