急性心肌梗死后心室重构相关基因的生物信息学分析

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摘要目的通过生物信息学分析探讨急性心肌梗死后心室重构的相关基因及功能。方法分析基因表达数据库中与心梗后心室重构有关的数据集。结果在GSE47495数据集中共筛选出611个差异表达基因（DEG）。在基因本体论分析中对DEG按照生物途径、分子功能、细胞定位注释。对DEG涉及的信号通路进行Pathway分析。蛋白与蛋白互相作用网络确定的核心基因有：酰基辅酶A氧化酶1（Acox1）、膜联蛋白A1（Anxa1）、凝血因子XⅢ A1链（F13a1）。药物筛选结果表明棕榈油、姜黄素可能调节这些基因。结论在心肌梗死后心室重构的发生过程中，出现表达变化的基因功能主要集中在代谢、细胞外基质、炎症、凝血方面，其中Acox1、Anxa1、F13a1可能发挥着重要作用，棕榈油、姜黄素可能调节这些基因，发挥改善心室重构的作用。

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关键词 ：急性心肌梗死, 心室重构, 基因, 生物信息学

Abstract：Objective To identify the molecular mechanisms underlying ventricular remodeling after myocardial infarction using bioinformatics methods. Methods Microarray data about ventricular remodeling after myocardial infarction were searched from GEO database. Results The array data of GSE47495 were obtained. A total of 611 DEG were identified. Gene ontology analysis showed that the DEG significantly enriched in biological processes, molecular function, and cell component. Pathway analysis showed the DEGs were involved in signaling pathways. The top 3 hub genes, Acox1, Anxa1, and F13a1 were identified from protein-protein interaction network. Results from drug screening indicated that palm oil and curcumin may regulate the above genes. Conclusion During post infarction ventricular remodeling, the identified DEG are mainly enriched in metabolism, extracellular matrix, inflammation, and coagulation. The hub genes, Acox1, Anxa1, and F13a1 provid potential targets for treatment of ventricular remodeling. Palm oil and curcumin may improve the ventricular remodeling through the regulation of these genes.

Key words： Acute myocardial infarction Ventricular remodeling Gene Bioinformatics

通讯作者: 张钲（1962-），男，博士，主任医师，教授，主要从事心血管疾病研究。

引用本文:

牛小伟1，2 张晶晶3 彭瑜2，4 白明2，4 张钲2，4. 急性心肌梗死后心室重构相关基因的生物信息学分析[J]. 中国医药导报, 2017, 14(30): 30-33.
NIU Xiaowei1,2 ZHANG Jingjing3 PENG Yu2,4 BAI Ming2,4 ZHANG Zheng2,4. Analyzing gene expression profiles in ventricular remodeling after myocardial infarction via bioinformatics methods. 中国医药导报, 2017, 14(30): 30-33.

链接本文:

http://www.yiyaodaobao.com.cn/CN/ 或 http://www.yiyaodaobao.com.cn/CN/Y2017/V14/I30/30

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